Tỉnh ủy Phú Thọ hay còn được gọi Ban chấp hành Đảng bộ tỉnh Phú Thọ, hay Đảng ủy tỉnh Phú Thọ. Là cơ quan lãnh đạo cao nhất của Đảng bộ tỉnh Phú Thọ giữa hai kỳ đại hội đại biểu Đảng bộ tỉnh.
Đứng đầu Tỉnh ủy là Bí thư Tỉnh ủy và thường là ủy viên Ban Chấp hành Trung ương Đảng.
Thực hiện Nghị quyết của Trung Ương, từ cuối năm 1939, xứ ủy Bắc Kỳ cử nhiều cán bộ về tỉnh Phú Thọ hoạt động và gây dựng cơ sở cách mạng ở một số nơi như Cẩm Khê, Thái Ninh (Thanh Ba). Trên địa bàn huyện Phù Ninh, các đồng chí Lương Khánh Thiện - ủy viên thường vụ Xứ ủy, đồng chí Trần Quý Kiên – Xứ ủy viên đã gây dựng những hạt giống tại hai cơ sở đầu tiên là Trạm Thản và xóm Cẩm Sơn (hay còn gọi là ấp Cẩm Sơn) thuộc xã Liên Hoa ngày nay.Đầu năm 1940, khi cơ sở cách mạng trong tỉnh mở rộng, số lượng đảng viên tăng, để thống nhất sự chỉ đạo, tháng 3 năm 1940 dựa trên cơ sở của 4 chi bộ đầu tiên trên địa bàn tỉnh,đồng chí Lương Khánh Thiện thay mặt Ban Thường vụ Xứ ủy Bắc Kỳ quyết định thành lập Ban cán sự tỉnh Phú Thọ gồm 5 đồng chí, do đồng chí Đào Duy Kỳ làm Bí thư và 4 thành viên. Hội nghị thành lập Đảng bộ tỉnh được tổ chức tại ấp Cẩm Sơn (nay thuộc xã Liên Hoa, huyện Phù Ninh, tỉnh Phú Thọ).
Tháng 1/1947 Đại hội Đại biểu Đảng bộ Phú Thọ tổ chức tại Cát Trù, huyện Cẩm Khê. Đại hội đã bầu Ban Chấp hành đảng bộ tỉnh, bí thư tỉnh ủy. Đại hội đã quyết định đổi tên Ban Cán sự Đảng tỉnh Phú Thọ thành Tỉnh ủy Phú Thọ.
Ngày 26/01/1968, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ra Nghị quyết 504-NQ/QH về việc hợp nhất hai tỉnh Phú Thọ và Vĩnh Phúc thành tỉnh Vĩnh Phú để phù hợp với yêu cầu và nhiệm vụ trong giai đoạn mới của cách mạng. Tháng 5/1968, Ban Chấp hành Trung ương Đảng chỉ định Ban Chấp hành lâm thời Đảng bộ tỉnh Vĩnh Phú.
Trong thời gian từ 1968-1996 Đảng bộ Phú Thọ và Đảng bộ Vĩnh Phúc hợp chung thành Đảng bộ Vĩnh Phú.
Ngày 12/12/1996, Bộ Chính trị, Ban Chấp hành Trung ương Đảng đã ra Quyết định số 117-QĐNS/TW thành lập Đảng bộ Phú Thọ và chỉ định Ban Chấp hành lâm thời của Đảng bộ.
Từ 1996 tới nay Đảng bộ được gọi là Tỉnh ủy Phú Thọ.
Tỉnh ủy Phú Thọ gồm các ban, đơn vị trực thuộc sau:
Văn phòng Tỉnh ủy
Ban Tổ chức Tỉnh ủy
Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy
Báo Phú Thọ
Trường Chính trị Tỉnh
Đảng ủy khối Doanh nghiệp tỉnh
Đảng uỷ khối các cơ quan tỉnh
Ban Tuyên giáo Tỉnh uỷ
Ban Nội chính Tỉnh ủy
Ban Dân vận Tỉnh ủy
Ban Bảo vệ sức khoẻ cán bộ tỉnh