Quy chế nhằm đánh giá tính đúng đắn, trung thực và hợp pháp của các số liệu, tài liệu, báo cáo quyết toán tài chính trong phạm vi được kiểm toán; đánh giá tính tuân thủ pháp luật, tính kinh tế, hiệu lực, hiệu quả trong quản lý, sử dụng các quỹ, tiền và tài sản nhà nước tại đơn vị. Nội dung hoạt động của kiểm toán nội bộ gồm: Kiểm toán báo cáo quyết toán tài chính; kiểm tra tính tuân thủ, chấp hành luật pháp; kiểm toán hoạt động, đánh giá tình hình thực hiện mục tiêu, nhiệm vụ ngành giao... Quy chế quy định về nguyên tắc, chế độ, trách nhiệm và quan hệ công tác hoạt động kiểm toán nội bộ trong hệ thống BHXH Việt Nam. Quy chế được áp dụng đối với các đơn vị, cá nhân là cán bộ, công chức, viên chức thuộc hệ thống BHXH Việt Nam; các cơ quan, đơn vị, tổ chức và cá nhân ngoài ngành BHXH có liên quan đến nội dung kiểm toán nội bộ của BHXH Việt Nam.
Ngoài ra, quy chế còn quy định về tiêu chuẩn của cán bộ làm công tác kiểm toán nội bộ; các hình thức kiểm toán nội bộ; chỉ đạo hoạt động kiểm toán nội bộ; nhiệm vụ, trách nhiệm và quyền hạn của các thành viên trong đoàn kiểm toán; trách nhiệm và quyền hạn các đơn vị được kiểm toán; mối quan hệ, phối hợp giữa các đơn vị trực thuộc BHXH Việt Nam; chế độ báo cáo kiểm toán; theo dõi, đôn đốc việc thực hiện kết luận, kiến nghị của kiểm toán nội bộ; quy định về lưu trữ hồ sơ và tài liệu kiểm toán...