Theo Cục Y tế dự phòng (Bộ Y tế), qua giám sát dịch bệnh cho thấy phần lớn các trường hợp mắc các bệnh sởi, ho gà hay một số các bệnh truyền nhiễm khác do không được tiêm hoặc tiêm chưa đầy đủ vắc xin phòng bệnh. Đặc biệt, thời gian gần đây có nhiều trẻ mắc bệnh sớm như bệnh ho gà ở trẻ 2-4 tháng tuổi, bệnh sởi khi trẻ trong khoảng thời gian 9 tháng -12 tháng tuổi (trẻ chưa đến tuổi tiêm vắc xin sởi –rubella nhưng lại không được tiêm vắc xin sởi khi trẻ đến 9 tháng tuổi).
Nguyên nhân trẻ chưa được tiêm chủng đầy đủ và đúng lịch là do: Các bà mẹ không nắm được trẻ em sau khi sinh cần được tiêm chủng những vắc xin phòng bệnh gì và lịch tiêm chủng như thế nào, đặc biệt là trẻ dưới 1 tuổi, do đó không chủ động cho con em mình đi tiêm chủng. Bên cạnh đó, nhiều người vẫn còn chưa tin tưởng vào chất lượng tiêm phòng vắc xin của Việt Nam.
Trả lời phỏng vấn về chất lượng và tính an toàn của vắc xin sử dụng trong Tiêm chủng mở rộng ở Việt Nam, Dr Kohei Todak, Chuyên gia WHO tại Việt Nam nhấn mạnh: Tôi biết rằng vắc xin sởi nội địa của Việt Nam được sản xuất với dây chuyền công nghệ của Nhật Bản và được WHO hỗ trợ có tính an toàn và chất lượng cao. Vắc xin Quinvaxem ngoại nhập cũng là một vắc xin an toàn và có chất lượng được tiền thẩm định bởi Cơ quan quản lý về vắc xin (NRA) được WHO chấp thuận. Tất cả các vắc xin trong chương trình Tiêm chủng mở rộng của Việt Nam đều thuộc kiểm soát của Hệ thống quản lý quốc gia của Bộ Y tế để quản lý chất lượng, tính hiệu quả và tính an toàn của vắc xin.